Taxonomie (biologie)

Parte dintr-o serie pe
Biologie evolutivă
cintezele lui Darwin by John gould
index Introducere Principal Contur Glosar Dovadă Istorie
Procese și rezultate Genetica populației Variație Diversitate Mutație Selecție naturală Adaptare polimorfismul Deviere genetică Fluxul genelor Speciație Radiații adaptive Cooperare Coevoluție Coextincția Divergență Convergenţă Evoluție paralelă Extincție
Istoria naturala Originea vieții Descendență comună Istoria vieții Cronologia evoluției Evolutia umana Filogenie Biodiversității Biogeografie Clasificare Taxonomie evolutivă Cladistică Fosilă de tranziție Eveniment de extincție
Istoria teoriei evoluției Companie Renaștere Înainte de Darwin Darwin Originea speciilor Înainte de sinteză Sinteză modernă Evoluția moleculară Evo-devo Cercetări actuale Istoria speciației Istoria paleontologiei (cronologie)
Domenii și aplicații Aplicații ale evoluției Criminologie biosocială Genetica ecologica Estetica evoluționistă Antropologia evoluționistă Calcul evolutiv Ecologie evolutivă Economia evoluționistă Epistemologie evoluționistă Etica evoluționistă Teoria evolutivă a jocurilor Lingvistică evoluționistă Medicină evolutivă Neuroștiința evoluționistă Fiziologia evoluționistă Psihologie evoluționistă Evoluție experimentală Filogenetica Paleontologie Creșterea selectivă Experimente de speciație Sociobiologie Biogeografia insulei Sistematică Darwinismul universal
Implicații sociale Evoluția ca fapt și teorie Efecte sociale Controversa creație-evoluție Evoluție teistă Obiecții la evoluție Nivel de suport
Portal de biologie evolutivă  Categorii
v t e

In biologie, taxonomie (De la Greaca antica τάξις (Taxiuri) „aranjament” și -noia (-nomie) 'metodă') este ştiinţific studiul denumirii, definirii (circumscriind) și clasificarea grupurilor de biologice organisme bazate pe caracteristici comune. Organismele sunt grupate în taxoni (singular: taxon) și aceste grupuri sunt date a rang taxonomic; grupurile de un anumit rang pot fi agregate pentru a forma un grup mai cuprinzător de rang superior, creând astfel o ierarhie taxonomică. Principalele ranguri în uz modern sunt domeniu, regat, filum (divizare este folosit uneori în botanică în locul filum), clasă, comandă, familie, gen, și specie. Botanistul suedez carl linnaeus este considerat ca fiind fondatorul sistemului actual de taxonomie, deoarece a dezvoltat un sistem clasificat cunoscut sub numele de taxonomia linneană pentru clasificarea organismelor şi nomenclatura binominala pentru denumirea organismelor.

Odată cu progresele în teoria, datele și tehnologia analitică a sistematicii biologice, sistemul linnean s-a transformat într-un sistem de clasificare biologică modernă menit să reflecte evolutiv relațiile dintre organisme, atât vii, cât și dispărute.

Definiție

Definiția exactă a taxonomiei variază de la sursă la sursă, dar nucleul disciplinei rămâne: concepția, denumirea și clasificarea grupurilor de organisme. Ca puncte de referință, definițiile recente ale taxonomiei sunt prezentate mai jos:

1. Teoria și practica grupării indivizilor în specii, aranjarea speciilor în grupuri mai mari și denumirea acestor grupuri, producând astfel o clasificare.
2. Un domeniu al științei (și componentă majoră a sistematică) care cuprinde descrierea, identificarea, nomenclatura și clasificarea
3. Știința clasificării, în biologie aranjarea organismelor într-o clasificare
4. „Știința clasificării aplicată organismelor vii, inclusiv studiul mijloacelor de formare a speciilor etc.”
5. „Analiza caracteristicilor unui organism în scopul clasificării”
6. „Studii de sistematică filogenie pentru a oferi un model care poate fi tradus în clasificarea și denumirile domeniului mai cuprinzător al taxonomiei" (enumerat ca o definiție de dorit, dar neobișnuită)

Definițiile variate fie plasează taxonomia ca o subzonă a sistematicii (definiția 2), inversează acea relație (definiția 6), fie par să considere cei doi termeni sinonimi. Există o oarecare dezacord cu privire la dacă nomenclatura biologică este considerată o parte a taxonomiei (definițiile 1 și 2) sau o parte a sistematicii din afara taxonomiei. De exemplu, definiția 6 este asociată cu următoarea definiție a sistematicii care plasează nomenclatura în afara taxonomiei:

• Sistematică: „Studiul identificării, taxonomiei și nomenclaturii organismelor, inclusiv clasificarea viețuitoarelor în ceea ce privește relațiile lor naturale și studiul variației și evoluției taxonilor”.

În 1970 Micheler et al. au definit „biologie sistematică” și „taxonomie” (termeni care sunt adesea confundați și utilizați interschimbabil) în relație unul cu celălalt, după cum urmează:

Biologia sistematică (denumită în continuare pur și simplu sistematică) este domeniul care (a) oferă nume științifice pentru organisme, (b) le descrie, (c) păstrează colecții ale acestora, (d) oferă clasificări pentru organisme, chei pentru identificarea lor și date despre distribuțiile lor, (e) investighează istoriile lor evolutive și (f) ia în considerare adaptările lor de mediu. Acesta este un domeniu cu o istorie îndelungată, care în ultimii ani a cunoscut o renaștere notabilă, în principal în ceea ce privește conținutul teoretic. O parte din materialul teoretic are de-a face cu domenii evolutive (subiectele e și f de mai sus), restul se referă în special la problema clasificării. Taxonomia este acea parte a sistematicii care se ocupă de subiectele (a) la (d) de mai sus.

Un întreg set de termeni, inclusiv taxonomie, biologie sistematică, sistematică, biosistematică, clasificare științifică, clasificare biologică și filogenetica au avut uneori semnificații care se suprapun – uneori aceleași, alteori ușor diferite, dar întotdeauna legate și intersectate. Cel mai larg sens al „taxonomiei” este folosit aici. Termenul în sine a fost introdus în 1813 de către de Candolle, în Théorie élémentaire de la botanique. John Lindley a oferit o definiție timpurie a sistematicii în 1830, deși a scris despre „botanica sistematică” mai degrabă decât să folosească termenul „sistematică”. Europenii tind să folosească termenii „sistematică” și „biosistematică” pentru studiul biodiversității în ansamblu, în timp ce nord-americanii tind să folosească „taxonomia” mai frecvent. Cu toate acestea, taxonomia și în special taxonomia alfa, este mai precis identificarea, descrierea și denumirea (adică nomenclatura) organismelor, în timp ce „clasificarea” se concentrează pe plasarea organismelor în cadrul unor grupuri ierarhice care arată relațiile lor cu alte organisme.

Monografie și revizuire taxonomică

A revizuire taxonomică or revizuire taxonomică este o analiză nouă a modelelor de variație într-un anumit taxon. Această analiză poate fi efectuată pe baza oricărei combinații a diferitelor tipuri de caractere disponibile, cum ar fi morfologice, anatomice, palinologice, biochimice și genetice. A monografie sau revizuire completă este o revizuire care este cuprinzătoare pentru un taxon pentru informațiile date la un anumit moment și pentru întreaga lume. Alte revizuiri (parțiale) pot fi restricționate în sensul că pot folosi doar unele dintre seturile de caractere disponibile sau pot avea o sferă spațială limitată. O revizuire are ca rezultat o conformare sau noi perspective în relațiile dintre subtaxa din cadrul taxonului studiat, ceea ce poate duce la o modificare a clasificării acestor subtaxa, la identificarea de noi subtaxa sau la fuziunea subtaxelor anterioare.

Caractere taxonomice

Caracterele taxonomice sunt atributele taxonomice care pot fi folosite pentru a furniza dovezi din care relații ( filogenie) între taxoni sunt deduse. Tipurile de caractere taxonomice includ:

Taxonomie alfa și beta

Termenul "taxonomia alfa" este folosit în principal astăzi pentru a se referi la disciplina de a găsi, descrie și numire taxoni, în special specii. În literatura anterioară, termenul avea un sens diferit, referindu-se la taxonomia morfologică și la produsele cercetării până la sfârșitul secolului al XIX-lea.

William Bertram Turrill a introdus termenul „taxonomie alfa” într-o serie de lucrări publicate în 1935 și 1937 în care a discutat despre filosofia și posibilele direcții viitoare ale disciplinei taxonomiei.

... există o dorință tot mai mare în rândul taxonomiștilor de a-și analiza problemele din puncte de vedere mai ample, de a investiga posibilitățile de cooperare mai strânsă cu colegii lor citologici, ecologici și de genetică și de a recunoaște că unele revizuiri sau extinderi, poate de natură drastică, dintre scopurile și metodele lor, ar putea fi de dorit... Turrill (1935) a sugerat că, deși acceptă taxonomia mai veche neprețuită, bazată pe structură și desemnată convenabil „alfa”, este posibil să se întrezărească o taxonomie la distanță construită ca o bază cât mai largă de fapte morfologice și fiziologice și una în care „se găsește locul tuturor datelor observaționale și experimentale referitoare, chiar dacă indirect, la constituția, subdiviziunea, originea și comportamentul speciilor și altor grupuri taxonomice”. Se poate spune că idealurile nu pot fi niciodată realizate complet. Ele au, totuși, o mare valoare de a acționa ca stimulenți permanenți și, dacă avem un ideal, chiar vag, de taxonomie „omega”, putem progresa puțin în alfabetul grec. Unii dintre noi ne fac plăcere crezând că acum bâjbâim într-o taxonomie „beta”.

Turrill exclude astfel în mod explicit din taxonomia alfa diverse domenii de studiu pe care le include în taxonomie în ansamblu, cum ar fi ecologia, fiziologia, genetica și citologia. El exclude în continuare reconstrucția filogenetică din taxonomia alfa.

Autorii de mai târziu au folosit termenul într-un sens diferit, pentru a însemna delimitarea speciilor (nu subspecii sau taxoni de alte ranguri), folosind orice tehnici de investigare sunt disponibile și incluzând tehnici de calcul sau de laborator sofisticate. Prin urmare, Ernst Mayr în 1968 a definit „taxonomie beta„ ca clasificare a rangurilor superioare speciilor.

Înțelegerea semnificației biologice a variației și a originii evolutive a grupurilor de specii înrudite este și mai importantă pentru a doua etapă a activității taxonomice, sortarea speciilor în grupuri de rude („taxa”) și aranjarea lor într-o ierarhie de categorii superioare. Această activitate este ceea ce denotă termenul de clasificare; este denumită și „taxonomie beta”.

Microtaxonomie și macrotaxonomie

Modul în care ar trebui să fie definite speciile într-un anumit grup de organisme dă naștere la probleme practice și teoretice care sunt denumite problema speciei. Lucrarea științifică de a decide modul de definire a speciilor a fost numită microtaxonomie.^{[sursa nesigură?]} Prin extensie, macrotaxonomia este studiul grupurilor la nivel superior rangurile taxonomice subgen și mai sus.

Istorie

În timp ce unele descrieri ale istoriei taxonomice încearcă să data taxonomia la civilizațiile antice, o încercare cu adevărat științifică de a clasifica organismele nu a avut loc până în secolul al XVIII-lea. Lucrările anterioare au fost în primul rând descriptive și s-au concentrat pe plante care erau utile în agricultură sau medicină. Există o serie de etape în această gândire științifică. Taxonomia timpurie se baza pe criterii arbitrare, așa-numitele „sisteme artificiale”, inclusiv LinnéSistemul lui de clasificare sexuală a plantelor (clasificarea animalelor a lui Linnaeus din 1735 era intitulată „Systema Naturae„(„Sistemul naturii”), implicând că el, cel puțin, credea că este mai mult decât un „sistem artificial”). Mai târziu au apărut sisteme bazate pe o analiză mai completă a caracteristicilor taxonilor, denumite „naturale”. sisteme”, precum cele ale de Jussieu (1789), de Candolle (1813) și Bentham și Hooker (1862–1863). Aceste clasificări au descris modele empirice și au fost pre-evolutiv în gândire. Publicarea lui Charles Darwin's Originea speciilor (1859) a condus la o nouă explicație pentru clasificări, bazată pe relații evolutive. Acesta a fost conceptul de filetice sisteme, din 1883 încoace. Această abordare a fost caracterizată de cele ale Eichler (1883) și engler (1886–1892). Apariția lui cladistice metodologia din anii 1970 a condus la clasificări bazate pe unicul criteriu al monofilie, susținută de prezența lui sinapomorfii. De atunci, baza probatorie a fost extinsă cu date de la genetica moleculara care în cea mai mare parte completează tradiționalul morfologie.^{[pagina necesară][pagina necesară][pagina necesară]}

Pre-Linnaean

Primii taxonomiști

Numirea și clasificarea mediului uman a început probabil odată cu apariția limbajului. Distingerea plantelor otrăvitoare de plantele comestibile este parte integrantă a supraviețuirii comunităților umane. Ilustrațiile cu plante medicinale apar în picturile murale egiptene din c. 1500 BC, indicând faptul că utilizările diferitelor specii au fost înțelese și că a existat o taxonomie de bază.

Cele mai vechi timpuri

Descrierea animalelor rare (写生珍禽图), de Dinastia Song pictor Huang Quan (903-965)

Organismele au fost mai întâi clasificate de Aristotel (Grecia, 384–322 î.Hr.) în timpul șederii sale pe Insula Lesbos. El a clasificat ființele după părțile lor sau în termeni moderni atribute, cum ar fi nașterea vie, a avea patru picioare, a depune ouă, a avea sânge sau a avea un corp cald. El a împărțit toate viețuitoarele în două grupe: plante și animale. Unele dintre grupurile sale de animale, cum ar fi Anhaima (animale fără sânge, tradus ca nevertebrate) Şi Enhaima (animale cu sânge, aproximativ vertebrate), precum și grupuri precum rechini și cetacee, sunt încă utilizate în mod obișnuit astăzi. Elevul lui Teofrast (Grecia, 370–285 î.Hr.) a continuat această tradiție, menționând aproximativ 500 de plante și utilizările lor în Historia Plantarum. Din nou, mai multe grupuri de plante încă recunoscute în prezent pot fi urmărite până la Teofrast, cum ar fi Cornus, șofran, și Narcis.

Medieval

Taxonomia în Evul Mediu s-a bazat în mare parte pe sistem aristotelic, cu completări referitoare la ordinea filozofică și existențială a creaturilor. Aceasta includea concepte precum mare lanț de ființă în Occident scolastic tradiţie, din nou derivând în cele din urmă de la Aristotel. Sistemul aristotelic nu a clasificat plantele sau ciuperci, din cauza lipsei de microscoape la momentul respectiv, deoarece ideile sale se bazau pe aranjarea întregii lumi într-un singur continuum, conform scala naturae (Scara naturală). Și aceasta a fost luată în considerare în marele lanț al ființei. Au fost făcute progrese de către savanți precum Procopius, Timotheos din Gaza, Demetrios Pepagomenos, și Toma d'Aquino. Gânditorii medievali au folosit categorisiri filozofice și logice abstracte mai potrivite pentru filosofia abstractă decât pentru taxonomia pragmatică.

Renaștere și modernitate timpurie

În timpul Renaștere si Epoca iluminării, clasificarea organismelor a devenit mai răspândită, iar lucrările taxonomice au devenit suficient de ambițioase pentru a înlocui textele antice. Acest lucru este uneori atribuit dezvoltării lentilelor optice sofisticate, care au permis studierea mult mai detaliată a morfologiei organismelor. Unul dintre primii autori care a profitat de acest salt în tehnologie a fost medicul italian Andrea Cesalpino (1519–1603), care a fost numit „primul taxonom”. Lui magnum opus De Plantis a apărut în 1583 și a descris mai mult de 1500 de specii de plante. Două familii mari de plante pe care le-a recunoscut pentru prima dată sunt încă folosite astăzi: Asteraceae și Brassicaceae. Apoi, în secolul al XVII-lea John ray (Anglia, 1627–1705) a scris multe lucrări taxonomice importante. Probabil că cea mai mare realizare a lui a fost Methodus Plantarum Nova (1682), în care a publicat detalii despre peste 18,000 de specii de plante. La acea vreme, clasificările sale au fost probabil cele mai complexe produse până acum de orice taxonom, deoarece și-a bazat taxonii pe multe caractere combinate. Următoarele lucrări taxonomice majore au fost produse de Joseph Pitton de Tournefort (Franța, 1656–1708). Opera sa din 1700, Institutions Rei Herbariae, a inclus peste 9000 de specii în 698 de genuri, ceea ce l-a influențat direct pe Linnaeus, deoarece acesta era textul pe care l-a folosit ca tânăr student.

epoca linneană

Pagina de titlu a Systema Naturae, Leiden, 1735

Botanistul suedez carl linnaeus (1707-1778) a inaugurat o nouă eră a taxonomiei. Cu operele sale majore Systema Naturae Ediția I în 1, Specia Plantarum în 1753, și Systema Naturae Ediția a VI-a, a revoluționat taxonomia modernă. Lucrările sale au implementat un sistem de denumire binom standardizat pentru speciile de animale și plante, care s-a dovedit a fi o soluţie elegantă la o literatură taxonomică haotică şi dezorganizată. El nu numai că a introdus standardul de clasă, ordine, gen și specie, dar a și făcut posibilă identificarea plantelor și animalelor din cartea sa, folosind părțile mai mici ale florii. Astfel, Sistemul linnean sa născut și este încă folosit în esență în același mod astăzi ca în secolul al XVIII-lea. În prezent, taxonomiștii de plante și animale consideră lucrarea lui Linnaeus drept „punctul de plecare” pentru nume valide (la 1753 și, respectiv, 1758). Numele publicate înainte de aceste date sunt denumite „pre-Linnaean” și nu sunt considerate valide (cu excepția păianjenilor publicate în Svenska Spindlar). Chiar și numele taxonomice publicate de însuși Linnaeus înainte de aceste date sunt considerate pre-Linnee.

Sistem modern de clasificare

Evolutia vertebrate la nivel de clasă, lățimea fusurilor indicând numărul de familii. Diagramele axului sunt tipice pentru taxonomie evolutivă

Aceeași relație, exprimată ca a cladogramă tipic pentru cladistică

Un model de grupuri imbricate în grupuri a fost specificat de clasificările lui Linnaeus ale plantelor și animalelor, iar aceste modele au început să fie reprezentate ca dendrograme a animalului si a plantei împărății spre sfârșitul secolului al XVIII-lea, cu mult înaintea lui Charles Darwin Originea speciilor a fost publicat. Modelul „sistemului natural” nu a implicat un proces generator, cum ar fi evoluția, dar poate să fi implicat-o, inspirând gânditorii transmutaționiști timpurii. Printre lucrările timpurii care explorează ideea de a transmutarea speciilor au fost erasmus darwinlui (a bunicului lui Charles Darwin) 1796 Zoonomia și Jean Baptiste Lamarck's Filosofie Zoologică din 1809. Ideea a fost popularizată în lumea anglofonă de către speculative, dar citite pe scară largă Vestigii ale istoriei naturale a creației, publicat anonim de Robert Chambers în 1844.

Cu teoria lui Darwin, a apărut rapid o acceptare generală că o clasificare ar trebui să reflecte principiul darwinian al descendență comună. Copacul Vieții reprezentările au devenit populare în lucrările științifice, cu grupuri de fosile cunoscute încorporate. Unul dintre primele grupuri moderne legate de strămoșii fosile a fost păsările.^[citare] Folosind fosilele nou descoperite atunci ale Archaeopteryx și hesperonis, Thomas Henry Huxley au declarat că au evoluat din dinozauri, un grup numit oficial de Richard Owen în 1842. Descrierea rezultată, aceea a dinozaurilor „care dă naștere” sau fiind „strămoșii” păsărilor, este semnul distinctiv esențial al taxonomică evolutivă gândire. Pe măsură ce tot mai multe grupuri de fosile au fost găsite și recunoscute la sfârșitul secolului al XIX-lea și începutul secolului al XX-lea, paleontologi a lucrat pentru a înțelege istoria animalelor de-a lungul veacurilor prin legarea între grupuri cunoscute. Cu sinteza evolutivă modernă de la începutul anilor 1940, a existat o înțelegere esențial modernă a evoluției grupurilor majore. Deoarece taxonomia evolutivă se bazează pe rangurile taxonomice linneene, cei doi termeni sunt în mare măsură interschimbabili în utilizarea modernă.

cladistice metoda a apărut încă din anii 1960. În 1958, Julian Huxley folosit termenul cladă. Mai târziu, în 1960, Cain și Harrison au introdus termenul cladistice. Caracteristica esențială este aranjarea taxonomiei într-o formă ierarhică arborele evolutiv, cu dezideratul că toți taxonii numiți sunt monofiletici. Un taxon se numește monofiletic dacă include toți descendenții unei forme ancestrale. Grupurile care au grupuri descendente eliminate din ele sunt denumite parafiletice, în timp ce grupurile care reprezintă mai mult de o ramură din arborele vieții sunt numite polifiletic. Grupurile monofiletice sunt recunoscute și diagnosticate pe baza sinapomorfii, stări de caractere derivate partajate.

Clasificările cladistice sunt compatibile cu taxonomia tradițională linneană și cu Codurile de Zoologic și Nomenclatura botanica. Un sistem alternativ de nomenclatură, cel Codul Internațional de Nomenclatură Filogenetică or PhyloCode a fost propus, a cărui intenție este de a reglementa denumirea formală a cladelor.^{[sursa nesigură?]} Rangurile linneene vor fi opționale sub PhyloCode, care este destinat să coexiste cu codurile actuale, bazate pe rang. Rămâne de văzut dacă comunitatea sistematică va adopta PhyloCode sau respinge-l în favoarea sistemelor actuale de nomenclatură care au fost folosite (și modificate după caz) de peste 250 de ani.

Regate și domenii

Schema de bază a clasificării moderne. Pot fi folosite multe alte niveluri; domeniul, cel mai înalt nivel în viață, este atât nou, cât și disputat.

Cu mult înainte de descoperirea lui Carl Linnaeus (botanist), plantele și animalele erau considerate regate separate.^{[sursa nesigură?]} Linnaeus l-a folosit ca rang superior, împărțind lumea fizică în regnurile vegetale, animale și minerale. Pe măsură ce progresele în microscopie au făcut posibilă clasificarea microorganismelor, numărul regatelor a crescut, sistemele cu cinci și șase regate fiind cele mai comune.

domenii sunt o grupare relativ nouă. Propus pentru prima dată în 1977, Carl Woese's sistem cu trei domenii nu a fost în general acceptată decât mai târziu. O caracteristică principală a metodei cu trei domenii este separarea Arheea și Bacteriile, grupate anterior în regnul unic Bacteria (un regat numit uneori monera), cu eucariote pentru toate organismele ale căror celule conţin a nucleu. Un număr mic de oameni de știință includ un al șaselea regat, Archaea, dar nu acceptă metoda domeniului.

Thomas Cavalier-Smith, care a publicat pe larg despre clasificarea protiști, în 2002 a propus ca Neomura, clada care grupează laolaltă Archaea și Eucarya, ar fi evoluat din Bacterie, mai exact din Actinomicetota. Clasificarea sa din 2004 a tratat arheobacterii ca parte a unui subreg al regnului Bacteria, adică a respins sistemul cu trei domenii în întregime. Stefan Luketa în 2012 a propus un sistem de cinci „dominii”, adăugând Prionobiota (acelular si fara acid nucleic) Şi Virusobiota (acelular dar cu acid nucleic) la cele trei domenii tradiționale.

Clasificări cuprinzătoare recente

Există clasificări parțiale pentru multe grupuri individuale de organisme și sunt revizuite și înlocuite pe măsură ce noi informații devin disponibile; cu toate acestea, tratamentele cuprinzătoare, publicate pentru majoritatea sau toată viața sunt mai rare; exemple recente sunt cele ale lui Adl et al., 2012 și 2019, care acoperă eucariotele doar cu accent pe protisti și Ruggiero et al., 2015, acoperind atât eucariotele cât şi procariote la rangul de Ordin, deși ambele exclud reprezentanții fosile. O compilație separată (Ruggiero, 2014) acoperă taxonii existenți la rangul de Familie. Alte tratamente bazate pe baze de date includ Enciclopedia Vieții, Global Biodiversity Information Facility, Baza de date taxonomie NCBI, Registrul interimar al genurilor maritime și nemarine, Deschide Arborele Vieții, Şi Catalogul Vieții. Baza de date Paleobiologie este o resursă pentru fosile.

aplicație

Taxonomia biologică este o subdisciplină a biologie, și este în general practicat de biologi cunoscuți ca „taxonomiști”, deși entuziaști naturalistilor sunt de asemenea implicați frecvent în publicarea de noi taxoni. Pentru că taxonomia își propune să descrie și să organizeze viaţă, munca desfășurată de taxonomiști este esențială pentru studiul biodiversitatea iar câmpul rezultat al biologia conservării.

Clasificarea organismelor

Clasificarea biologică este o componentă critică a procesului taxonomic. Ca urmare, informează utilizatorul despre care sunt ipotezați rudele taxonului. Clasificarea biologică utilizează ranguri taxonomice, inclusiv printre altele (în ordinea de la cel mai incluziv la cel mai puțin incluziv): domeniu, regat, Filum, Clasă, comandă, Familie, gen, specie, și Strain.^{[notă 1]}

Descrieri taxonomice

Tip specimen pentru Nepenthes smilesii, un tropical plantă de ulcior

„Definiția” unui taxon este încapsulată prin descrierea sau diagnosticul său sau prin ambele combinate. Nu există reguli stabilite care să guverneze definirea taxonilor, dar denumirea și publicarea noilor taxoni sunt guvernate de seturi de reguli. In zoologie, nomenclatură pentru rangurile mai frecvent utilizate (superfamilie la subspecie), este reglementată de Codul Internațional de Nomenclatură Zoologică (Cod ICZN). În domeniile de fiziologie, micologie, și botanică, denumirea taxonilor este guvernată de Codul internațional de nomenclatură pentru alge, ciuperci și plante (ICN).

Descrierea inițială a unui taxon implică cinci cerințe principale:

1. Taxonului trebuie să i se dea un nume bazat pe cele 26 de litere ale alfabetului latin (a binom pentru specii noi, sau uninomial pentru alte ranguri).
2. Numele trebuie să fie unic (adică nu a omonim).
3. Descrierea trebuie să se bazeze pe cel puțin un nume purtând specimen tip.
4. Ar trebui să includă declarații despre atributele adecvate fie pentru a descrie (defini) taxonul, fie pentru a-l diferenția de alți taxoni (diagnostic, Cod ICZN, articolul 13.1.1, ICN, articolul 38, care se poate baza sau nu pe morfologie). Ambele coduri separă în mod deliberat definirea conținutului unui taxon (s circumscripție) din definirea numelui său.
5. Aceste prime patru cerințe trebuie publicate într-o lucrare care poate fi obținută în numeroase exemplare identice, ca înregistrare științifică permanentă.

Cu toate acestea, adesea sunt incluse mult mai multe informații, cum ar fi aria geografică a taxonului, note ecologice, chimie, comportament etc. Modul în care cercetătorii ajung la taxonii lor variază: în funcție de datele și resursele disponibile, metodele variază de la simple. cantitativ or calitativ comparații de caracteristici izbitoare, pentru a elabora analize computerizate de cantități mari de secvență de ADN de date.

Citarea autorului

O „autoritate” poate fi plasată după o denumire științifică. Autoritatea este numele omului de știință sau al oamenilor de știință care au publicat pentru prima dată numele. De exemplu, în 1758 Linnaeus a dat Elefant asiatic denumirea științifică elephas maximus, așa că numele este uneori scris ca „elephas maximus Linnaeus, 1758”. Numele autorilor sunt frecvent prescurtate: abrevierea L., Pentru Linné, este folosit în mod obișnuit. În botanică, există, de fapt, o listă reglementată de abrevieri standard (vezi lista botanicilor după prescurtarea autorului). Sistemul de atribuire a autorităților diferă ușor între botanică și zoologie. Cu toate acestea, este standard ca, dacă genul unei specii a fost schimbat de la descrierea inițială, numele autorității inițiale să fie plasat între paranteze.

Fenetica

O comparație a conceptelor filogenetice și fenetice (bazate pe caractere).

În fenetică, cunoscută și sub numele de taximetrie sau taxonomie numerică, organismele sunt clasificate pe baza similitudinii generale, indiferent de filogenie sau relațiile lor evolutive. Rezultă o măsură a „distanței” hipergeometrice dintre taxoni. Metodele fenetice au devenit relativ rare în vremurile moderne, în mare măsură înlocuite de cladistice analizele, deoarece metodele fenetice nu disting ancestralele comune (sau pleziomorfă) trăsături din derivate comune (sau apomorf) trăsături. Cu toate acestea, anumite metode fenetice, cum ar fi alăturarea vecinului, au persistat, ca estimatori rapidi ai relațiilor atunci când metodele mai avansate (cum ar fi Inferența bayesiană) sunt prea costisitoare din punct de vedere computațional.

Baze de date

Utilizări taxonomie moderne Baza de date tehnologii pentru căutarea și catalogarea clasificărilor și documentarea acestora. Deși nu există o bază de date utilizată în mod obișnuit, există baze de date cuprinzătoare, cum ar fi Catalogul Vieții, care încearcă să enumere fiecare specie documentată. Catalogul enumera 1.64 milioane de specii pentru toate regnurile din aprilie 2016, pretinzând acoperirea a mai mult de trei sferturi din speciile estimate cunoscute științei moderne.

Vezi si

notițe

Referinte

Bibliografie

Link-uri externe

• Ce este taxonomia? de la Muzeul de Istorie Naturală din Londra
• Taxonomie at NCBI il Centrul Național de Informare Biotehnologică
• Taxonomie at UniProt il Resursa universală de proteine
• ESTE il Sistemul Informațional Taxonomic Integrat
• CETaF il Consorțiul Facilităților Taxonomice Europene
• Wikispecii director de specii gratuit
• Clasificarea biologică. arhivată 13 august 2020 la Wayback Masini